Ayon sa kaugalian, ang mga ilog ng Nepal ay maaaring nahahati sa tatlong kategorya (depende sa uri ng pagkain). Ang una ay mga ilog na pinakain ng natutunaw na mga glacier. Ang pangalawa ay ang mga ilog na nagmula sa bukana ng Mahabharat. Ang iba pa ay iba`t ibang mga agos at ilog, na ang mapagkukunan ay nasa Sivalik ridge.
Ilog ng Bagmati
Dumaan ang Bagmati sa mga lupain ng gitnang Nepal at estado ng Bihar ng India. Ang pinagmulan ng ilog ay nasa mga bundok at nabuo sa pamamagitan ng pagdugtong ng maraming hindi pinangalanan na mga sapa (mga 15 na kilometro mula sa Kathmandu).
Ang tubig ng Bagmati ay sagrado sa parehong Hinduismo at Budismo. Maraming mga templo ng Hindu sa mga pampang ng ilog.
Ilog ng Barun
Dumaan si Barun sa silangang mga teritoryo ng gitnang Nepal at ang tamang tributary ng Ilog Arun.
Ang pinagmulan ng ilog ay ang Berun glaciers na matatagpuan sa bundok ng Makalu. Ang pangunahing direksyon ng kasalukuyang ay silangan at timog-silangan. Ang ilog ay bahagi ng sistema ng ilog ng Kosi, na kinabibilangan ng malalaking ilog tulad ng: Arun; Tamur; Sun-Kosi; Indravati; Dudh Kosi; Bhola Kosi.
Ilog ng gandak
Ang ilog ay dumadaloy sa teritoryo ng Nepal at India. Ang Gandak ay isa sa apat na pinakamalaking ilog ng Nepalese. Ang pinagmulan ng ilog ay nasa Himalayas, sa kambal ng dalawang ilog: Muztang Khola; Kyugoma Khola. Sa itaas na lugar, ang ilog ay tinatawag na Kali-Gandak. Ang pagsasama ng Gandak ay ang tubig ng Ilog ng Ganges. Ang lambak ng ilog ay isang ruta ng kalakalan na nagkokonekta sa India at Tibet.
Ang lambak ng Ilog Gandak ay kagiliw-giliw din dahil hinati nito ang Great Himalayan Range sa dalawang bahagi, dumadaan sa pagitan ng dalawang tuktok - Annapura at Daulagiri.
Ilog ng Ghaghra
Dumaan si Ghaghra sa mga lupain ng tatlong estado - Nepal, China at India. Ang kabuuang haba ng kasalukuyang 950 kilometro at ito ang pinakamalalim na daloy ng tubig na nagpapakain sa magagaling na Ganges.
Ang pinagmulan ng ilog ay matatagpuan sa teritoryo ng Tibetan Plateau (katimugang bahagi, lugar ng Lake Manasarovar). Ang Ghaghra ay ang pinakamahaba at pinakamalaking ilog na matatagpuan sa Nepal. Ang pangunahing uri ng pagpapakain ng ilog: sa itaas na abot ay ang tubig ng mga glacier at natunaw na niyebe; ang mas mababang abot ay pinakain sa panahon ng doji. Lalo na ang ilog ay ganap na umaagos sa tagsibol at tag-init. Sa oras na ito ng taon, posible ang matinding pagbaha sa Ghaghra. Ang tubig ng ilog ay pangunahing ginagamit para sa patubig.
Ilog ng Dudh-Kosi
Ang isa sa mga ilog na Nepalese, na isa sa pinakamataas na ilog ng bundok hindi lamang sa bansa, kundi sa buong mundo. Ang pinagmulan ng ilog ay ang Lake Gokyo. Pagkatapos ang kasalukuyang bumaba sa tract na Namche-Bazar, kung saan ang tubig ng Dudh-Kosi ay nagsasama sa isa pang ilog - Bhote-Kosi.
Ang ilog ay perpekto lamang para sa rafting, ngunit dapat tandaan na ang rutang ito ay hindi angkop para sa mga nagsisimula.
Ilog ng Rapti
Ang Rapti ay isang ilog sa Nepal at India, na may kabuuang haba na 600 na kilometro. Ang pinagmulan ng ilog ay nasa teritoryo ng mga bundok ng Sivalik.